日前台南市政府宣導使用後的衛生紙直接丟馬桶，不僅較環保，而且每年還可以節省數億元的垃圾清運費用。不過，環保署卻指出，在國內污水下水道不普及，衛生紙丟入馬桶後的輸送與後續處理耗能，以及民眾不易辨識衛生紙材質的情況下，環保署現階段並不鼓勵民眾把用過的衛生紙直接丟馬桶。

台灣民眾習慣上廁所將用過的衛生紙丟垃圾桶，但台南市政府衛生局卻宣導直接丟馬桶的新觀念，強調目前衛生紙其實都可溶於水，這樣一來，預估全國1年可節省新台幣6億元的衛生紙清理處理費用，也可以避免污穢衛生紙在開放式垃圾桶散播細菌。不過，環保署卻表示，衛生紙沖馬桶雖然方便解決廢棄物問題，但目前市售一般盒裝及隨身面紙，質地屬於「長纖」纖維，遇水不易碎爛，直接丟入馬桶將容易發生排水管線阻塞問題。

環保署水質保護處科長王岳斌說：『一般民眾沒辦法去分辨什麼是衛生紙、短纖、長纖的，我們去日本看，日本那個衛生紙有經驗的人都知道，一用就會破，最主要原因是因為他很多的成分是用再生的，我們大部分的衛生紙都是用處女紙漿來做，如果量很大的話，基本上隨著糞便的話，有可能有些管線比較小的地方，就容易會有阻塞的問題。』

王岳斌指出，目前我國公共污水下水道普及率只有約18%而已，污水下水道並不普及，如果將衛生紙投入馬桶，一旦未妥善處理，將增加河川中污染物質濃度。此外，如果從節能減碳的觀點來看，衛生紙使用後丟馬桶，在管路輸送到污水處理廠的過程中，仍必須以馬達加壓輸送、耗費能源，加上如果不慎把生理及盥洗清潔用品投入馬桶，將造成馬桶阻塞，因此，現階段環保署並不鼓勵衛生紙丟馬桶。