交通部高鐵局負責施工興建的機場捷運，目前逐步進入工程高峰期，有關機場捷運未來的「營運問題」，交通部日前已經做出原則決定，將依照大眾捷運法的相關規範，採用「指定」方式，交給「桃園縣政府」負責營運。據了解，桃園縣政府將與台北捷運公司以籌組公營公司的模式，接手機場捷運的營運。至於原本爭取的台北捷運公司以及台鐵，都已經確定出局。

據了解，原本交通部屬意台鐵負責經營「直達」及「站站停」兩種模式的機場捷運，不過，台鐵缺乏「大眾捷運」的營運經驗，至於最有經驗的台北捷運公司，對於委託經營提出的附帶條件頗多，並且對於未來機場捷運的獲利狀況並不看好。讓交通部傷透腦筋。近來台北市政府因為柵湖線的問題忙得焦頭爛額，對於多接手一條路線營運的意願，或許也大為降低。

至於桃園縣政府，則是在最後階段表達強烈意願，由於機場捷運部分路網也將成為桃園捷運路網的一部份，因此基於發展本身營運能力的考量，桃園縣政府積極爭取，獲得交通部的青睞。不過，桃園縣政府缺乏未來捷運的所需的人力以及專業經營知識，因此，考慮透過籌組營運公司的模式，邀請台北捷運公司入股，提供經驗技術，協助桃園建立營運團隊。